赣州市（县级）（1980年－1998年）
1987年，恢复设置市水上办事处。1987年4月5日，沙石乡、蟠龙乡改设沙石镇、蟠龙镇。1989年11月23日，设立蛤湖、龙埠二乡。
1993年11月17日，撤销水东乡，设立水东镇。1997年6月5日，设立黄金街道办事处。赣州市辖5个街道、3个镇、6个乡：解放街道、赣江街道、南外街道、水上街道、黄金岭街道、蟠龙镇、沙石镇、水东镇、水西乡、水南乡、湖边乡、沙河乡、蛤湖乡、龙埠乡。 1998年8月5日，撤销湖边乡、水南乡、沙河乡，设立湖边镇、水南镇、沙河镇。1998年8月5日，将南外街道办事处分设为东外、南外街道办事处。
1998年12月7日，撤销水上办事处，将其所辖交解放街道办事处。
章贡区
2000年，章贡区辖5个街道、6个镇、3个乡。
2000年12月8日，撤销水西乡，设立水西镇，镇政府迁至赤珠岭。2001年3月2日，撤销龙埠乡，划归沙石镇；撤销蛤湖乡，划归湖边镇。截至2014年底，章贡区总人口67万人。
2004年底，章贡区辖5街道7镇。
2009年5月，市委、市政府日前决定将湖边镇的建制划入赣州经济技术开发区（以下简称“开发区”）管辖。辖4个街道、5个镇。
2012年末，章贡区辖5街道、9镇，有56个居委会（社区） 、99个行政村。其中，黄金岭街道、蟠龙镇、湖边镇、潭东镇、潭口镇由赣州经济技术开发区治理；章贡区实辖水东镇、水南镇、水西镇、沙石镇、沙河镇等5个镇和解放街道、赣江街道、南外街道、东外街道等4个街道办事处，共57个行政村、 48个街道社区居民委员会和12个镇辖居民委员会；下设809个居民小组，513个村民小组。
2014年2月25日，原南康市潭东镇、潭口镇划归赣州市章贡区管辖。