今新会地，新石器时代已有百越人聚居，战国时为百越地，秦、汉属南海郡。
三国吴黄武元年（222），官府以今司前镇河村乡附近为治所置平夷县，这是新会地设立行政区划的开始。晋恭帝元熙二年（420）置新会郡，新会之名自此始。隋开皇十年（590）撤新会郡置新会县。隋唐间置冈州，历经废兴，贞观十三年（639年）重置冈州后移治于今会城。新会境域最广时为南朝宋元嘉十二年（435），面积约8419平方公里。此后近1600年间，先后划地置（归）香山（今中山）、顺德、恩平、新宁（今台山）、开平、鹤山、斗门、江门等。
清末，新会境内开始修筑新宁铁路。民国时又修筑新鹤、江佛等多条公路交汇在县城东北10千米的江门镇，新会县城的交通枢纽地位逐渐由江门镇取代。1925年11月26日，江门正式脱离新会独立成市，直到1931年2月26日才复归新会管辖。
1951年1月12日，江门重新设市。1977年9月22日，外海公社及荷塘公社的潮连岛划归江门市，结束新会县域包围江门市的历史。1984年3月，全县撤公社建区。1986年11月24日，全县20个区全部撤区建镇。
1992年撤县设市。2000年，新会市辖18个镇：会城镇、大泽镇、七堡镇、司前镇、牛湾镇、罗坑镇、 小冈镇、双水镇、崖西镇、崖南镇、沙堆镇、古井镇、三江镇、睦洲镇、大鳌镇、荷塘镇、棠下镇、杜阮镇。2002年6月22日，撤销县级新会市，设立新会区。新会区辖原县级新会市的会城镇、大泽镇、司前镇、沙堆镇、古井镇、三江镇、崖门镇、双水镇、罗坑镇、大鳌镇、睦洲镇。新会区人民政府驻会城镇。原县级新会市的棠下镇、荷塘镇、杜阮镇划归江门市蓬江区管辖。2005年，撤销会城镇，设立会城街道办事处，作为新会区政府的派出机关。会城街道办事处管辖原会城镇的行政区域范围，共有17个居委会和29个村委会，总面积140.66平方千米，户籍人口265170人。